Pengelolaan sampah masih diperhadapkan pada beberapa tantangan yakni meningkatnya jumlah timbunan sampah sebagai akibat dari bertambahnya jumlah penduduk dan pola konsumsi masyarakat, belum memadainya sarana dan prasarana pengelolaan sampah, belum optimalnya partisipasi masyarakat dan kesadaran masyarakat dalam pengelolaan sampah, belum optimalnya peningkatan regulasi dan peraturan, pengolahan sampah perbatasan dan sampah teluk, topografi dan orbital asli wilayah yang berdampak pada pelayanan pengangkutan serta peningkatan pendapatan asli daerah dari retribusi sampah.
Oleh karena itu, rencana ini sangatlah penting. Rencana induk yang diwujud dan harus menyeluruh mencakup elemen-elemen kunci seperti pembatasan timbunan sampah dan daur ulang pemanfaatan kembali pemilahan, pengumpulan, pengangkutan, pengelolaan dan pemrosesan akhir sampah serta pendanaan. Rencana ini yang ditetapkan untuk durasi minimal 10 tahun mencerminkan dedikasi kota Ambon terhadap pengolahan sampah yang bertanggung jawab dan berkelanjutan.
Upaya memperkuat pengelolaan sampah di Kota Ambon. Waste4Change dan Green Moluccas berupaya memperkuat pengelolaan sampah di Kota Ambon, Maluku melalui program USAID Clean Cities, Blue Ocean (USAID CCBO). Program USAID CCBO telah berhasil mengelola lebih dari 6.100 ton sampah, termasuk mencegah 1.276 ton sampah plastik bocor ke lingkungan dan meningkatkan kapasitas 2 TPS 3R dan 4 Bank Sampah melalui bantuan teknis dan hibah.
